一大队太平军保护着他们的幼天王悄悄进入江西地面。
左宗棠一面派出援军，一面将军情上奏给朝廷。
一
巧的是，左宗棠的折子抵达京师的时候，曾国藩正带着曾国荃以下出力将弁，
圣旨这样写道：
曾国藩奏克复金陵，全股悍贼数歼灭。又据曾国荃奏，亲讯李万材，供称：“城破后，伪忠王之兄、巨王、幼西王、幼南王、定王、崇王、璋王等，乘夜冲出，被官军马队追至湖熟桥边，将各头目全行杀毙，更无余孽。”曾国荃又奏，据城内各贼供称：“首逆洪秀全实系本年五月间，官军猛攻时，服毒而死，瘗于伪宫院内。立幼主洪天贵福重袭伪号。城破后，伪幼主积薪宫殿举火自焚。”又奏，至伪忠王李秀成一犯，城破受伤，匿于山内民房，十九夜提督萧孚泗亲自搜出，并擒王次兄洪仁达。二十日，曾国荃亲讯，供认不讳等语。览奏朕心实悦。钦差大臣协办大学士两江总督曾国藩，自咸丰四年
接下来，圣旨又对记名提督李臣典、萧孚泗等一班大将逐一封赏。
按照曾国荃的说法，金陵城里所有的这个王那个王，都被他的部下剿杀，无一漏网。曾国藩相信了自己弟弟的说法，把弟弟的汇报原封不动地转奏给了朝廷。
第二道圣旨这样写道：
钦差大臣科尔沁博勒噶台亲王僧格林沁，已迭次加恩晋封亲王，世袭罔替，著加赏一贝勒，令其子布彦讷谟祜受封。钦差大学士湖广总督官文，加恩锡封一等伯爵，世袭罔替，并加恩将其本支毋庸仍隶内务府旗籍，著抬入正白旗满洲，赏戴双眼花翎。江苏巡抚李鸿章，著加恩锡封一等伯爵，并赏戴双眼花翎。长江水师提督杨岳斌，加恩赏加一等轻车都尉世职，并赏加太子少保衔。兵部右侍郎彭玉麟，著赏加一等轻车都尉世职，并赏加太子少保衔。
圣旨又
闽浙总督署浙江巡抚左宗棠、江西巡抚沈葆桢等均候闽、赣等省军务平定后再行加恩。
但江西巡抚沈葆桢与闽浙总督左宗棠的奏折进京后，形势立时急转直下，朝廷马上给两江总督衙门追
据沈葆桢奏，江西潜入大股贼匪。又据左宗棠奏，刘典
圣旨最后又特别注明：“该旨著抄送左宗棠、沈葆桢看。”
二
左宗棠见到这道圣旨后，无异于晴天遭遇了霹雳，险些晕倒
他万没想到，曾国藩
值得庆幸的是，朝廷并未因此事而把曾国藩怎么样，只是责令其“严查太平门缺口防守不力人员”。设若朝廷因此事而降罪于曾国藩，左宗棠不仅无颜面对曾家兄弟，也无颜面对湘系的所有统兵大员，亦无颜面对李鸿章及其所属淮系的统兵将领。
左宗棠开始忧心忡忡，不知如何面对自己的恩公曾国藩。
后来，左宗棠的家眷入闽，路过金陵时，特意进城到两江总督府盘桓了几日。临离开时，曾国藩让左宗棠的老诰命周诒端，给左宗棠捎了一句话。
当周诒端把曾国藩的这句话说给左宗棠后，左宗棠始而困惑，渐渐沉思，很快便明白过来了。左宗棠从此后才把一颗惴惴不安的心放进肚子里。
曾国藩让周诒端捎给左宗棠一句什么话呢？
曾国藩捎给左宗棠的话是：安心为国家办事，不要轻易便上一些人的当。
左宗棠乍听之下不解，不明白谁敢让自己上当。但经过一番思考后，他终于想明白了，挑拨他与曾国藩之间关系的这个人，不是别人，正是朝廷。
大清国朝廷不怕曾、左之间不睦，最怕他们之间和睦。他们最担心刚消灭一个洪秀全，又起来一个曾国藩。
蓄意挑拨二人之间的关系，正是为了让皇家血脉能够永远地延续下去。让汉人掌兵已是犯了朝廷大忌，若再容许湘楚之间继续亲密下去，大清国恐怕也就走到头了。这是所有满人最不希望
朝廷的这些心思，能瞒得了别人，却瞒不过曾国藩。
表面上看，曾国藩与左宗棠之间出现了隔阂，两个人明显有了距离，其实，两个人的心更近了。
三
同治三年（公元1864年）八月二十七日，一篇由曾国藩亲自草拟的《曾国荃请开缺调理折》由两江总督衙门拜
一月以来延医诊视，日进汤药，病势有增无减。缘怔忡旧患，起于心血先亏，而成于忧劳过甚。从前数月一
折子到京不久，朝廷即下达圣谕：准曾国荃暂行开缺回籍养疾，浙江巡抚著马新贻补授；马新贻未到任前，浙江巡抚著蒋益澧署理；浙江布政使著杨昌濬署理。
接到圣旨的当日，曾国荃含恨离开金陵大营，乘船赶往湘乡。
曾国荃前脚离开金陵，曾国藩后脚就
曾国藩
近岁以来，但见增勇，不见裁撤，无论食何省之饷，所吸者皆斯民之脂膏，所损者皆国家之元气。前此贼氛方盛，万不得已，屡募屡增，以救一时之急。今幸老巢既破，大局粗定，裁一勇即节一勇之靡费，亦即销无穷之后患。诸将之愿遣散归籍，盖未始非臣之幸，未始非大局之幸……求所以善聚不如善散，善始不如善终之道。
曾国藩此奏，正迎合了朝廷的心理，自然没有不准之理。
但左宗棠却不希望湘军全部裁撤掉。他想为湘军保存一支血脉，也算对恩公曾国藩的一种报答。
但因为没有机会，左宗棠只能等等看。
这时，法国新任驻华公使柏尔德密，带着参赞武官等一应随员，赶到杭州来见左宗棠。